编译安装LAMMPS

之前实习的时候最后一个工单是编译安装LAMMPS,可惜是最后一个工作日接的,而且网上的资料比较旧,以前版本的安装方法现在已经不适用,所以没来得及装完。虽然离职以后这已经和我没啥关系了,然而自己依旧觉得不爽,所以回来以后在自己的系统上摸索了一下,终于弄清楚怎么装了。下面写一下我的安装过程。

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用BLAS+LAPACK或OpenBLAS或MKL编译安装SciPy

昨天有一个工单,涉及到编译安装SciPy。如果在个人电脑上,对性能没有太大要求的,可以直接在Linux下用包管理器安装好或者在Windows下安装已经打包好的SciPy。然而在对性能有需求的地方,还是需要进行编译安装的。另外,国内的超级计算机基本上都是在一个内网里,不接入外网,要登陆使用必须挂VPN,所以自然是不能用包管理器的了。NumPy和SciPy一般是一起装的,matplotlib依赖这两个。NumPy的线性代数部分依赖现有的高性能线性代数库,比如Intel MKL、AMD ACML、GotoBLAS2、LAPACK、ATLAS等。网上的文章很多都说要用ATLAS + LAPACK来装,但我没用这个方法。最大的原因是,ATLAS在安装的时候会检测CPU是否有睿频,有的话要频率开到最大才能继续编译安装。但是一般用户没有sudo权限,所以只能另寻他法。找了一圈试了一下以后发现可以只装netlib的BLAS和LAPACK来安装SciPy,或者用OpenBLAS来装(其实也要用到netlib的LAPACK),或者用MKL来装。
装这个包这两天折腾了我好久。好在问题总算解决了,我整理了一下我的安装步骤,以供参考。
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完整的Arch Linux安装记录+一些感想

提醒:此文更新时间为2014年9月,有些操作可能已经失效,安装请参阅 Arch Wiki。推荐参阅 此教程 。

2017.8.26 Update: 我最近在 U 盘上装了一次,和在电脑上装的区别不大,除了一开始用 U 盘进行引导和重新分区以外。再次推荐上面提到的那篇教程作为参考。

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